Ingénieur développement en informatique (H/F)

Publié le mar 21/06/2022 - 13:28
Type de contrat
CDD
Contexte
L'IRISA (Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires) est aujourd'hui l'un des plus grands laboratoires de recherche français (+ de 850 personnes) dans le domaine de l'informatique et des nouvelles technologies de l'information. Structuré en sept départements scientifiques, le laboratoire constitue un pôle de recherche d'excellence avec des priorités scientifiques telles que : la bio-informatique, la sécurité des systèmes, les nouvelles architectures logicielles, la réalité virtuelle, l'analyse des masses de données et l'intelligence artificielle.
Le candidat sera rattaché à l'équipe GenScale, IRISA, Beaulieu, Rennes.
GenScale est une équipe de recherche en bioinformatique. Son objectif principal est de développer des méthodes, des outils et des logiciels évolutifs pour le traitement des données génomiques. Les recherches sont motivées par le développement rapide des technologies de séquençage de nouvelle génération (NGS) et de troisième génération (TGS) qui posent des problèmes très difficiles tant en termes de bioinformatique que d'informatique.
Mission

La mission de l'ingénieur d'études s'inscrit dans le cadre d'un projet de recherche européen, le projet BioPIM, programme EIC PATHFINDER, qui a démarré en mai 2022. Ce projet a, entre autre, pour objectif de paralléliser et d'évaluer des algorithmes du domaine de la génomique sur une architecture de type « Processing-in-Memory » (PIM). L'architecture matérielle s'appuie sur une nouvelle mémoire DRAM développée par la société UPMEM (partenaire du projet) permettant de créer des barrettes mémoire de 8 Go qui intègrent en leur sein 128 micro-processeurs. Plus spécifiquement, la mission sera de développer, de paralléliser, d'implémenter, de tester et de valider des algorithmes du domaine de la génomique sur des architectures PIM.

Activités

• Paralléliser des algorithmes du domaine de la génomique sur PIM
• Mettre en œuvre la parallélisation sur des serveurs UPMEM
• Évaluer les performances
• Participer activement au projet européen BioPIM

Profil / Compétences
Connaissances
• Langage de programmation : C, C++, Python
• Méthodologies de test et d'intégration continue
• Parallélisme
• Anglais technique
Niveau de formation
• Ingénieur, Master
Domaine de formation
• Informatique, Génie logiciel
NB : des connaissances en génomique ne sont pas requises
Date prévisionnelle d'embauche
Date limite de candidature
Durée du contrat (en mois)
36
Candidater
https://emploi.cnrs.fr/Offres/CDD/UMR6074-DOMLAV-004/Default.aspx