BAP
A
Type de contrat
CDD
Corps / Catégorie
IGR
Département
Equipe de recherche
Contexte
L'IRISA (Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires) est aujourd'hui l'un des plus grands laboratoires de recherche français (+ de 850 personnes) dans le domaine de l'informatique et des nouvelles technologies de l'information. Structuré en sept départements scientifiques, le laboratoire constitue un pôle de recherche d'excellence avec des priorités scientifiques telles que : la bio-informatique, la sécurité des systèmes, les nouvelles architectures logicielles, la réalité virtuelle, l'analyse des masses de données et l'intelligence artificielle.
Le candidat sera rattaché principalement à l'équipe GenScale, IRISA, Beaulieu, Rennes (D. Lavenier), mais une partie de la mission s'effectuera à l'IGDR, Villejean, Rennes, dans l'équipe GED (Y. Audic)
GenScale est une équipe de recherche en bioinformatique. Son objectif principal est de développer des méthodes, des outils et des logiciels évolutifs pour le traitement des données génomiques. Les recherches sont motivées par le développement rapide des technologies de séquençage de nouvelle génération (NGS) et de troisième génération (TGS) qui posent des problèmes très difficiles tant en termes de bioinformatique que d'informatique.
L'équipe "Gene expression and development" (GED) étudie les régulations post-transcriptionnelles, en utilisant essentiellement comme modèles l'amphibien xénope, les cellules en culture et la souris. Ces recherches ont un fort impact pour la compréhension de certaines pathologies chez l'humain.
Pour ces 2 équipes, le projet dnarXiv représente un nouvel axe de recherche.
Le candidat sera rattaché principalement à l'équipe GenScale, IRISA, Beaulieu, Rennes (D. Lavenier), mais une partie de la mission s'effectuera à l'IGDR, Villejean, Rennes, dans l'équipe GED (Y. Audic)
GenScale est une équipe de recherche en bioinformatique. Son objectif principal est de développer des méthodes, des outils et des logiciels évolutifs pour le traitement des données génomiques. Les recherches sont motivées par le développement rapide des technologies de séquençage de nouvelle génération (NGS) et de troisième génération (TGS) qui posent des problèmes très difficiles tant en termes de bioinformatique que d'informatique.
L'équipe "Gene expression and development" (GED) étudie les régulations post-transcriptionnelles, en utilisant essentiellement comme modèles l'amphibien xénope, les cellules en culture et la souris. Ces recherches ont un fort impact pour la compréhension de certaines pathologies chez l'humain.
Pour ces 2 équipes, le projet dnarXiv représente un nouvel axe de recherche.
Mission
La mission de l'Ingénieur de Recherche s'inscrit dans le cadre du projet dnarXiv (https://project.inria.fr/dnarxiv/). Il aura pour mission de développer l'ensemble des approches biologiques amont et aval du programme dnarXiv. C'est-à-dire, de mettre au point en amont, éventuellement en collaboration avec un partenaire privé (DNA Script, partenaire du projet dnarXiv), la synthèse longue des ADN. Coté aval, l'IR aura pour mission de réaliser les séquençages des molécules produites par la technologie Nanopore et d'effectuer le traitement bioinformatique des données résultantes
Profil / Compétences
Connaissances
- Biologie moléculaire des acides nucléiques, clonage, séquençage haut débit, réalisation de banques et séquençage
- Réglementation en matière d'hygiène et de sécurité
- Des connaissances informatiques en analyse de données de séquençage haut débit sont requises
- Langue anglaise : B2 à C1 (cadre européen commun de référence pour les langues)
Compétences opérationnelles
- Concevoir des dispositifs expérimentaux
- Développer une expertise scientifique et technologique dans le domaine de la production et de l'analyse de séquences ADN à vocation de stockage d'information
- Utiliser les logiciels spécifiques à l'activité
- Rédiger des documents scientifiques
Formation
- Doctorat
- Domaine de formation souhaité : biologie moléculaire des acides nucléiques, biotechnologie et bioinformatique
- Biologie moléculaire des acides nucléiques, clonage, séquençage haut débit, réalisation de banques et séquençage
- Réglementation en matière d'hygiène et de sécurité
- Des connaissances informatiques en analyse de données de séquençage haut débit sont requises
- Langue anglaise : B2 à C1 (cadre européen commun de référence pour les langues)
Compétences opérationnelles
- Concevoir des dispositifs expérimentaux
- Développer une expertise scientifique et technologique dans le domaine de la production et de l'analyse de séquences ADN à vocation de stockage d'information
- Utiliser les logiciels spécifiques à l'activité
- Rédiger des documents scientifiques
Formation
- Doctorat
- Domaine de formation souhaité : biologie moléculaire des acides nucléiques, biotechnologie et bioinformatique
Diplôme requis
Doctorat
Lieu de travail
IRISA et IGDR
Date prévisionnelle d'embauche
Date limite de candidature
Durée du contrat (en mois)
24
Quotité
100%
Salaire brut mensuel
entre 2460 et 2800 € mensuel bruts selon expérience
Candidater
https://emploi.cnrs.fr/Offres/CDD/UMR6074-DOMLAV-001/Default.aspx