Optimisation des paramètres d’acquisition en IRM de diffusion pour la reconstruction de la connectivité cérébrale

Defense type
Thesis
Starting date
End date
Location
IRISA Rennes
Room
la salle E108 du bâtiment 2B
Speaker
Constance BOCQUILLON (EMPENN)
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Theme
L'IRM de diffusion est une méthode non invasive pour sonder la microstructure des tissus, en mesurant le déplacement des molécules d'eau. Toutefois, les informations extraites du signal dépendent fortement du schéma d'acquisition. Ce dernier doit trouver un équilibre entre la sensibilité aux caractéristiques de la microstructure et les contraintes pratiques telles que le temps d'acquisition et la qualité du signal. Cette thèse porte sur l'optimisation du protocole d'acquisition en IRM de diffusion, plus précisément dans le cadre d'acquisitions multidimensionnelles, où l'acquisition est encodée à l'aide de b-tenseurs.
La principale contribution de ce travail est le développement d'un cadre adapté à la conception de protocoles d'acquisition maximisant la sensibilité aux paramètres d'intérêt. Une seconde contribution vise à comprendre la signification physique pour la microstructure  d'un paramètre d'intérêt du modèle. Enfin, la génération de fantômes plus adaptés à l'estimation des effets de l'acquisition par b-tenseurs sur la tractographie par filtrage a été initiée.
Composition of the jury
Composition du Jury :
Président : Pierre MAUREL Professeur des universités, Université de Rennes, Rennes, France
Examinateurs : Alessandro DADUCCI Assistant Professor, University of Verona, Italy
Jing-Rebecca LI Directrice de recherche, ENSTA Paris, France
Cyril POUPON Directeur de recherche, CEA Neurospin, France
François ROUSSEAU Professeur des Universités, IMT Atlantique, France
Chantal TAX Fonction et établissement d’exerciceAssistant Professor, UMC Utrecht, Netherlands
Membres invités : Emmanuel CARUYER Chargé de recherche, Directeur de la thèse, CNRS, HDR, Rennes, France
Isabelle COROUGE Ingénieure de recherche, Co-encadrante de la thèse, Université de Rennes, Rennes,