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Jeudi 5 janvier 2012 - Hélène Chiapello (INRA Jouy-en-Josas) |
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Written by Pierre PETERLONGO
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Alignement de génomes bactériens : méthodes, évaluation et exemples
d'applications.
10h30 Salle Aurigny
Les méthodes d'alignement de génomes sont devenues un outil
essentiel de la génomique
comparée bactérienne et les outils disponibles se sont multipliés au
cours de ces dernières années.
Dans cet exposé je présenterai une revue rapide des méthodes
actuelles permettant de
réaliser des alignements de génomes complets bactériens. Je décrirai
aussi quelques
approches récentes qui permettent d'évaluer et comparer la qualité
des résultats d'alignements
obtenus. Enfin j'aborderai des exemples d'applications de ces
méthodes en microbiologie évolutive :
(i) analyse de la variabilité génomique à l'échelle micro-évolutive,
(ii) analyse des profils mutationels
de motifs fonctionnels, et (iii) aide à l'assemblage et l'annotation
automatique de génomes "drafts".
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