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Jeudi 19 Mai, Sophie Schbath (Unité Mathématique, Informatique et Génome, INRA Jouy-en-Josas) |
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Written by Pierre PETERLONGO
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Comparaison d'outils de mapping pour les données NGS
10h30 SalleMinquiers
Devant le nombre important d'outils existant pour aligner de courtes
lectures sur un génome de référence, nous avons entrepris une étude
comparative de 8 de ces outils à partir de jeux de données simulés. Les
résultats de cette comparaison illustreront les points forts/faibles de
ces outils, la quasi-totalité reposant sur des heuristiques.
Travail en collaboration avec Julien Fayolle, Jean-François Gibrat, Valentin Lous et Véronique Martin
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