Grégory Ranchy

Ingénieur Expert INRIA au sein de l'équipe Symbiose
courriel : gregory.ranchy@irisa.fr
Téléphone : 02 99 84 71 19
Bureau : D150 (bâtiment D, niveau Orange)

Activité principale

• Ingénieur de la plate-forme de bioinformatique de Ouest Genopole
• Responsable du sytème de management de la qualité de la plate-forme de bioinformatique de Ouest Genopole
• Valorisation des compétences de l'équipe dans l'analyse de séquences
  

Réalisations au sein de l'équipe

• Développements de logiciels de recherche.
  
• Développements spécifiques pour la migration des logiciels de la plate forme vers un cluster de calcul.
  
• Mise en place d'un système de management de la qualité pour la plate-forme (ISO 9001:2000).
  
• Animation du groupe 'recommandation de développement' de l'équipe Symbiose.
• Administration du nouveau site web de l'équipe.
  
• Administration du WIKI de l'équipe.
• Administration du projet gforge de la plate-forme de bioinformatique.
  
• Participation à la réorganisation du site web de la plate-forme de bioinformatique.
• Interface web du logiciel BioQuali (bientôt en ligne).
  
• Interface web du logiciel STAN en collaboration avec Anne-Sophie Valin
• Interface web du logiciel WAPAM de Mathieu Giraud
• Développement de Sequence Retrieval et de son interface web.
  
• Préparation de la création d'une jeune pousse :
  
  • Participation à la rédaction de la demande de brevet n° 0413150
  • Dépôt APP de STAN
    
  • Demande de concours scientifique auprès de la commission de déontologie pour Jacques Nicolas et Dominique Lavenier

Publications

• Nicolas J, Durand P, Ranchy G, Tempel S, Valin AS. Suffix-tree analyser (STAN): looking for nucleotidic and peptidic patterns in chromosomes.
• Thomas D, Bron P, Ranchy G, Duchesne L, Cavalier A, Rolland JP, Raguenes-Nicol C, Hubert JF, Haase W, Delamarche C : Aquaglyceroporins, one channel for two molecules.

Liste à jour de toutes mes publications.

Formation initiale

• 2003 : DESS Compétences Complémentaires en Informatique
• 2002 : DEA Génomique et Informatique
• 2001 : Maîtrise de Biologie Cellulaire et Physiologie
• 2000 : Licence de Biologie Cellulaire et Physiologie

Expérience professionnelle

• Depuis Février 2003 : Ingénieur en bioinformatique dans l'équipe de recherche Symbiose de l'IRISA.
• 2003 : Vacataire assistant formateur dans la société de formation en bioinformatique ES-Bioinfo.
  Participation à huit modules à destination de chercheurs de l'INRA, CNRS et INSERM
• 2003 : Développement du site web es-bio.info et de ses cinq services internes.
  Stage de DESS de 4 mois
• 2002 : Développement de fonctions bioinformatiques d'analyse de séquences dans l'équipe de recherche Biologique SDM de l'UMR6026 CNRS
  Stage de DEA de 6 mois
• 2001 : Développement de fonctions bioinformatiques d'analyse de séquences dans l'équipe de recherche Biologique SDM de l'UMR6026 CNRS
  Stage de Maîtrise de 4 mois

Compétences

• Langages objets :
  

• Python (sockets,  cgi,  pydoc, thread,  pytest,  doxygen)
• Java (Junit, Eclipse,  javadoc,  Java 1.5,  parseur XML SAX,  XML mapping avec castor, ant)

• Langages Web :
  

• PHP (version 4)
  
• JavaScript
• XHTML (transitional et strict)
  
• CSS (2.0)
  

• Utilisation des logiciels d'analyse de séquences biologiques courants
• Utilisation des principales bases de données bioinformatiques

Autres activités

• Depuis 2002 : Donne des cours hebdomadaires de bureautique pour débutants dans la ville de Chantepie
• 2003 : Administration de l'ordinateur personnel sous Linux (Serveurs apache, samba, spamassassin, mysql)
  
• 2005 : Développement et gestion du site web (codé en ASP) de la crèche d'entreprise Ty bon'home en bénévolat.
• 2005 : Développement et gestion d'un site web personnel (LAMP) et de son interface d'administration.
  
• 2006 : Développement et gestion du site web de l'entreprise Maison des poissons (LAMP) et de son interface d'administration permettant une gestion de données en bénévolat.