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Jeudi 5 janvier 2012 - Hélène Chiapello (INRA Jouy-en-Josas)
Written by Pierre PETERLONGO   

Alignement de génomes bactériens : méthodes, évaluation et exemples d'applications.

10h30 Salle Aurigny

Les méthodes d'alignement de génomes sont devenues un outil essentiel de la génomique
comparée bactérienne et les outils disponibles se sont multipliés au cours de ces dernières années.
Dans cet exposé je présenterai une revue rapide des méthodes actuelles permettant de
réaliser des alignements de génomes complets bactériens. Je décrirai aussi quelques
approches récentes qui permettent d'évaluer et comparer la qualité des résultats d'alignements
obtenus. Enfin j'aborderai des exemples d'applications de ces méthodes en microbiologie évolutive :
(i) analyse de la variabilité génomique à l'échelle micro-évolutive, (ii) analyse des profils mutationels
de motifs fonctionnels, et (iii) aide à l'assemblage et l'annotation automatique de génomes "drafts".
 


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