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Jeudi 24 Novembre 2011, Stéphane Le Crom (IBENS, Paris)
Written by Pierre PETERLONGO   

Analyses de données de séquençage à haut débit grâce au cloud computing

10h30 Salle Aurigny
Nous avons développé sur la plateforme génomique de la Montagne Sainte Geneviève une chaîne d'analyse 
modulaire dédiée à l'analyse des données de séquençage à haut débit et basée sur Hadoop une implémentation
de l'algorithme MapReduce de distribution des calculs. Ce programme permet à l'utilisateur de facilement 
configurer une infrastructure de cloud computing et d'automatiser l'analyse de plusieurs échantillons à la fois en 
utilisant différentes solutions logicielles disponibles sur le marché. Nos tests ont démontré que le coût des calculs 
est proportionnel au nombre de serveurs réservés ainsi qu'à l'augmentation de la quantité de données à analyser.
 


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