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Jeudi 19 Mai, Sophie Schbath (Unité Mathématique, Informatique et Génome, INRA Jouy-en-Josas)
Written by Pierre PETERLONGO   

Comparaison d'outils de mapping pour les données NGS

10h30 SalleMinquiers Devant le nombre important d'outils existant pour aligner de courtes lectures sur un génome de référence, nous avons entrepris une étude comparative de 8 de ces outils à partir de jeux de données simulés. Les résultats de cette comparaison illustreront les points forts/faibles de ces outils, la quasi-totalité reposant sur des heuristiques.
Travail en collaboration avec Julien Fayolle, Jean-François Gibrat, Valentin Lous et Véronique Martin
 


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