Symbiose Project Team - INRIA/Irisa © 2007 - 2008


Ludmila SARBU

lsarbu Title Expert Engineer
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Address Symbiose Projet - Room D 154
  INRIA/Irisa - Campus de Beaulieu
  35042 RENNES Cedex - France
Tel +33 2 99 84 22 34
   
   
   
   


Current Positions INGENIEUR EN DEVELOPPEMENT LOGICIEL POUR LA BIOINFORMATIQUE
  RESPONSABLE QUALITE DE LA PLATE-FORME DES SERVICES A LA RECHERCHE EN BIOINFORMATIQUE GENOUEST


MISSIONS EN TANT QUE RESPONSABLE QUALITE DE LA PLATE-FORME BIOINFORMATIQUE GENOUEST:

    * Conduite du point Qualité lors des réunions bimensuelles.
    * Formation de l’équipe à ISO 9001 et au SMQ existant pour les nouveaux arrivants.
    * Accompagnement au passage au certificat ISO 9001 :2008.
    * Conduite au changement (amélioration continue) et animation qualité quotidienne. Gestion documentaire.
   * Conseil en Management de la Qualité aux 2 plate-formes du Biogenouest (réseau des plate-formes technologiques partenaires) préparant la certification, en occurence: Synanovect (Vecteurs de synthèse lipidique pour la délivrance de médicaments) et la Plate-forme de Séquençage de la Station Biologique de Roscoff.


PROJETS DE DEVELOPPEMENT LOGICIEL:

- PDB RELATIONNELLE  Développement: PERL / C, POSTGRESQL - sous la direction de J.F.Gibrat, MIG, Jouy-en-Josas.
Briève description du projet: L'objectif de ce projet est d’inclure dans une base de données relationnelle des informations relatives à la structure 3D des protéines. Nous désirions créer un modèle qui puisse décrire l’ensemble des données contenues dans les fichiers
de la Protein Databank at Brookhaven (PDB), c’est à dire, en sus de la structure 3D proprement dite, les informations annexes sur la bibliographie, les conditions expérimentales, les liens avec les autres bases de données (de séquences protéiques, d’enzymes, etc.)

 

- PHYMYCO DB   Développement: JAVA, mySQL, PHP pour l'interface -en collaboration avec Stéphane Mahé, Philippe Vandenkoornhuyse, UMR 6553 CNRS ECOBIO, CAREN, Université de Rennes 1
Briève description du projet: We propose a fungal sequence database, PHYMYCO-DB for use in facilitating the analysis of fungal diversity in the environment and addressing evolutionary questions. We focus on two widely used molecular taxonomic markers: the SSU rRNA and EF1-a gene sequences. All available fungal sequences from GenBank were filtered to satisfy sequence quality criteria.  Several  thousands of high quality fungal sequences of the SSU rRNA gene and several hundreds of EF1-a gene respectively, are provided.

 

 


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