Journals
- D. Lavenier, G. Georges, X. Liu, A Reconfigurable Index
FLASH Memory tailored to Seed-Based Genomic Sequence Comparison
Algorithms, The Journal of VLSI signal processing systems.
Special issue on Computing Architectures and Acceleration for
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Conferences
- P. Peterlongo, L. Noé, D. Lavenier, G. Georges, J. Jacques,
G. Kucherov, M. Giraud, Protein similarity search with subset
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on Parallel Computational Biology, Gdansk, Poland, September
9-12, 2007
- M. Giraud, G. Kucherov, D. Lavenier, L. Noé, P. Peterlongo,
Utilization of Subset Seeds on a Reconfigurable Architecture, LAW
2007 (London Algorithm Workshop), King's College London, UK,
February 7-8 2007 (pdf)
- D. Lavenier, X. Xinchun, G. Georges, Seed-based Genomic Sequence
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2006 (pdf)
- G. Georges, S. Derrien, S. Rubini, F. Raimbault, L. Amsaleg,
D. Lavenier, ReMIX: une architecture pour la recherche dans les masses
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Machines, Perpignan, France, 2006.
(pdf)
- V.H. Nguyen, D. Lavenier, Recherche dans les banques d'ADN par
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innovation & vision for the future, Ho Chi Minh Ville, Vietnam,
2006. (pdf)
National Events
- P. Pertelongo, Flash: Optimisation de graines et indexation
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Journées nationales des ARC INRIA, Rennes, oct. 2007 (pdf)
- Poster ReMIX : Mémoire Reconfigurable pour l' Indexation des
masses de données. Séminaire PaRISTIC, Bordeaux, 21-23 novembre 2005.
(pdf)
- E. Popovici, G. Ménier, P.F. Marteau, Recherche approchée
d'information dans une base de documents semi-structurés : une
application ReMIX. Séminaire PaRISTIC, Bordeaux, 21-23 novembre 2005.
(pdf)
- D. Lavenier, ReMiX : Mémoire Reconfigurable pour l' Indexation des masses de
données. Journées de l'ACI MD, Paris, 16-17 octobre 2004.
(pdf)
- F. Raimbault, D. Lavenier, Le projet ReMIX et ses applications en génomique. Journées de
l'Action Spécifique "Indexation de texte et découverte de motifs"
(ASIM), Réunion thématique, Faculté des Sciences, Nantes, 27-28 mai
2004.
(pdf)
Technical Documentation
- H. Darolles, Rapport de spécification. Synthèse automatique sur plateforme FPGA,
MASTER ASCI, 2eme année (UPMC), juin 2006
( pdf).
- H. Darolles, Plateforme ReMIX, manuel d'utilisation, mai 2006
( pdf).
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