FASTA

Les 4 étapes du calcul des 3 scores (étapes 3 et 4)

3 - Phase de compatibilités des segments au sein d'un même alignement et calcul de INITn

                                    ^         .   .
                                    |        .   .
---                                 |       .  /.
\                                   |   /  .  /.
 > scores compatibles = INITn       |  /  . / .  /
/                                   | /  . / .  /
---                                 |   . / .
                                    |  . / .      /
                                    | .   .      /
                                     --------------->

4 - Phase d'optimisation autour de INITn et calcul de OPT

                                    ^
                                    |          /
                                    |   /    _/
                                    |  /    /    /
   score optimisé = OPT             | /    /    /
                                    |     /
                                    |    /        /
                                    |            /
                                     --------------->