FASTA

Les 4 étapes du calcul des 3 scores (étapes 1 et 2)
  1. Pour chaque comparaison : construction d'un "dot plot" suivant le "k-tup" 
    
                                    ^
                                    |          /
                                    |   /     /
seq test :     A T G C T T A        |  /    /    /
                 | | |              | /    /    /
seq banque :   T T G C C G C        |     /
                                    |    /        /
                                    |            /
                                     --------------->
  2. Conservation des 20 meilleurs segments et calcul de INIT1 en tenant compte des coûts de substitution 
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                                    |          /
                                    |   /     /
                                    |  /    /    /
                                    | /    /    /
                                    |     /
                                    |    /        /
                                    |            /
                                     --------------->