FASTA

Les 4 étapes du calcul des 3 scores (étapes 1 et 2)
  1. Pour chaque comparaison : construction d'un "dot plot" suivant le "k-tup"
    
                                        ^
                                        |          /
                                        |   /     /
    seq test :     A T G C T T A        |  /    /    /
                     | | |              | /    /    /
    seq banque :   T T G C C G C        |     /
                                        |    /        /
                                        |            /
                                         --------------->
    
    
  2. Conservation des 20 meilleurs segments et calcul de INIT1 en tenant compte des coûts de substitution
                                        ^
                                        |          /
                                        |   /     /
                                        |  /    /    /
                                        | /    /    /
                                        |     /
                                        |    /        /
                                        |            /
                                         --------------->